本隊於民國89年成立，原名{女子警察隊}，創隊初期以家庭暴力及性侵害案件處理、失蹤兒童查訪協尋、婦幼安全犯罪預防宣導、校園安全維護等工作為主。

民國92年內政部警政署鑑於「女子警察隊」以性別命名，常致使於女警隊執行勤、業務之男性員警產生困擾，亦易造成婦幼安全工作係女警工作範疇之錯誤認知，經參酌各界意見，將「女子警察隊」名稱修正為「婦幼警察隊」。

民國94年9月本隊因應「婦幼警察隊」組織編制修正增置刑事警力，本隊工作性質從預防性勤務轉變為預防與偵處並重，刑事人員積極偵辦轄內性侵害、兒少性剝削、性騷擾案件，行政人員防治婦幼被害案件之發生，落實各項業務之執行及相關法令之宣導，結合社會資源推動婦幼安全工作，期能有效提昇本縣婦幼人身安全預防與偵查之效能及服務品質。